Genetik yatkınlık ve çevredeki alerjenin bir araya gelmesi ile önce vücutta bebeklik döneminden itibaren bir duyarlılaşma oluşur. Bu duyarlılık sonucu bağışıklık sistemi normalde bu maddeye karşı salgılamaması gereken IgE adında bir antikor salgılar. Bu antikor kan dolaşımı ile vücudun her tarafına dağılarak bağışıklık sistemi hücrelerine yapışır. Eğer alerjen vücuda bir daha ulaşırsa hemen onu tanır ve çok şiddetli bir reaksiyon verir. Bu reaksiyon esnasında bağışıklık sisteminden salgılanan binlerce madde alerjenin etki yarattığı organda anormal şiddette bir alerjik yangı oluşturur ve hastalığın bulgularının çıkmasına neden olur. Bu eğer alerjik yangı burunda ise hapşırma burun akıntısı burun kaşıntısı gözlerde yanma sulanma ile karakterli olan saman nezlesine akciğerde bronşlarda ise hırıltılı nefes alıp verme nefes darlığı ve koyu balgam çıkarma ile ortaya çıkan alerjik bronş astımına deride ise kaşıntı kızarıklık ve kuruluğa neden olan alerjik egzemaya barsakda ise karın ağrısı ishal kusma ve barsaklar dışında bir çok bulguya neden olan besin alerjisine vs neden olur . Alerjiye neden olan bağışıklık sistemimizin çevremizdeki alerjenlere olan anormal ve şiddetli reaksiyonu olduğu ve bağışıklık sistemi hücreleri vücudumuzda kan dolaşımı olan her yerde olduğu için alerji bulguları yalnızca o organda değil bir çok ayrı organda görülebilir. Örneğin sadece migren tipi baş ağrıları göğüs ağrıları hareketesiz yaşama isteği inatçı öksürük sık sık ve uzun süreli nezle olma çocuklarda büyüme de gerilik gibi bulgular da alerji nedenli olabilir.