Habib Neccar Medresesi (Merkez)
Habib Neccar Camisi’nin yanına yapılan Antakya’nın en eski medreselerinden biri olan Habib Neccar medresesi 1903 yılına kadar öğrenime açıktı. Cami avlusunu iki yönden çeviren Halil Ağa isimli bir hayırseverin yaptırdığı medrese, sonraki yıllarda Mürselzâde Hasan Ağa tarafından tümüyle yenilenmiş ve bunu belirten bir kitabe de doğu tarafındaki odalardan biri üzerine yerleştirilmiştir. Kitabe şöyledir:
“Hayrı cari eyledi bunda Halil Ağa bina
Gel oku dersi hulkûs ile ona eyle duâ
Oldu tamiri tamam o dedi tarihini tam
Kıldı Mürselzade İhsan hücre inşa kâmilen
1280”.
Bu medresede Antakya’nın ünlü kişilerinden Mahmut Hoca ve Kömürçukurlu Ali Efendi ders vermiştir. Medresenin yanı başında da Habib Neccar’ın mektebi bulunmaktaydı. Burada da 1898-1923 yıllarında da Mehmet Kâzım Uncu ders vermiştir. I.Dünya Savaşı yıllarında Hafız Ahmet ve Hacı Recep Efendiler, daha sonra da Ahmet Hamdi, Tavilzade Mehmet Efendi burada ders vermişlerdir.
Zincirli Medrese (Merkez)
Habib Neccar yapı topluluğunun karşısındaki Zincirli Medresede 1930 ve 1931 yıllarına kadar hizmet sürdürülmüştür. Antakya’da ünlü hocaları yetiştiren Davut-u Antakî’nin okuduğu, hocalık ve hekimlik yaptığı bu medrese Kurtuluş Caddesi genişletilirken yıkılmıştır. Ancak caminin batı duvarı dışındaki küçük alanda kime ait olduğu bilinmeyen üç mezar korunmuştur.
